下设负责对外情报的「花组」、负责对内情报的「月组」、负责后勤的「风组」、以及负责行政工作的「雪组」。
橘笃子（天璋院）为首任团长，橘舞为首任副团长，紫阳为首任参谋。
花菱团的本部设于东京都的花菱大剧院，表面以花菱歌剧团为掩护。
花菱团的存在被严格保密，普罗大众并不知道这个人气爆棚，所有团员都是顶级美女的国民级歌剧团，其实是一个大号的谍报机关。
1877年3月，旧武家残党成立组织「天诛会」，以「夺回日本，重塑武家权威」为最高纲领，不择手段地对抗新选组，频繁地在日本国内发起骇人听闻的恐怖袭击。
1882年，得益于花菱团提供的情报，新选组彻底扫清日本国内的天诛会势力。
1885年，新选组捣毁天诛会的朝鲜分部。
1892年，新选组捣毁天诛会的欧洲分部。
1893年，本应是奄奄一息的天诛会突然振作起来，实力大增。
新选组与天诛会的对抗，从此陷入僵持状态。
1910年10月，一对老夫妇突然找上青登。
青登隆重地接待了他们，并与他们彻夜长谈。
没人知道他们的谈话内容。
